MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015184	CCG	2	6	82456	82461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168367
1502	NC_015184	AGGT	2	8	82594	82601	25 %	25 %	50 %	0 %	325168367
1503	NC_015184	GA	3	6	82609	82614	50 %	0 %	50 %	0 %	325168367
1504	NC_015184	CGGA	2	8	82735	82742	25 %	0 %	50 %	25 %	325168367
1505	NC_015184	GAA	2	6	82769	82774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168367
1506	NC_015184	GTT	2	6	82963	82968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168368
1507	NC_015184	GCA	2	6	82984	82989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168368
1508	NC_015184	TCA	2	6	83021	83026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168368
1509	NC_015184	AAG	2	6	83089	83094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168368
1510	NC_015184	TGC	2	6	83231	83236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168368
1511	NC_015184	GAAT	2	8	83274	83281	50 %	25 %	25 %	0 %	325168368
1512	NC_015184	AACCG	2	10	83344	83353	40 %	0 %	20 %	40 %	325168368
1513	NC_015184	ATC	2	6	83450	83455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168368
1514	NC_015184	GCG	2	6	83485	83490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168368
1515	NC_015184	CGT	2	6	83553	83558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168368
1516	NC_015184	TGC	2	6	83603	83608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168368
1517	NC_015184	AAG	2	6	83612	83617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168368
1518	NC_015184	GGC	2	6	83707	83712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168368
1519	NC_015184	AC	3	6	83744	83749	50 %	0 %	0 %	50 %	325168368
1520	NC_015184	CGG	2	6	83759	83764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168368
1521	NC_015184	GAT	2	6	83803	83808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168368
1522	NC_015184	GCC	2	6	84523	84528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168369
1523	NC_015184	TCT	2	6	84557	84562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168369
1524	NC_015184	CTT	2	6	84578	84583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168369
1525	NC_015184	CAG	2	6	84584	84589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168369
1526	NC_015184	CAA	2	6	84596	84601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168369
1527	NC_015184	GTG	2	6	84615	84620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168369
1528	NC_015184	TCG	2	6	84642	84647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168369
1529	NC_015184	CGG	2	6	84667	84672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168369
1530	NC_015184	CCG	2	6	84696	84701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168369
1531	NC_015184	ACC	2	6	84711	84716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168369
1532	NC_015184	CTT	2	6	84749	84754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168369
1533	NC_015184	GCC	2	6	84776	84781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168369
1534	NC_015184	GA	3	6	85061	85066	50 %	0 %	50 %	0 %	325168370
1535	NC_015184	GT	3	6	85137	85142	0 %	50 %	50 %	0 %	325168370
1536	NC_015184	ATT	2	6	85147	85152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168370
1537	NC_015184	AGC	2	6	85193	85198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1538	NC_015184	GCC	2	6	85220	85225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168370
1539	NC_015184	GA	3	6	85295	85300	50 %	0 %	50 %	0 %	325168370
1540	NC_015184	TC	3	6	85358	85363	0 %	50 %	0 %	50 %	325168370
1541	NC_015184	GCG	2	6	85485	85490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168370
1542	NC_015184	GCA	2	6	85526	85531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1543	NC_015184	CTG	2	6	85579	85584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1544	NC_015184	CAG	2	6	85707	85712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1545	NC_015184	GCA	2	6	85727	85732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1546	NC_015184	CTG	3	9	85737	85745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168370
1547	NC_015184	T	7	7	85789	85795	0 %	100 %	0 %	0 %	325168370
1548	NC_015184	TTGG	2	8	85829	85836	0 %	50 %	50 %	0 %	325168371
1549	NC_015184	CGG	2	6	85868	85873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168371
1550	NC_015184	AAC	2	6	85881	85886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168371
1551	NC_015184	TGTCC	2	10	85980	85989	0 %	40 %	20 %	40 %	325168371
1552	NC_015184	CAG	2	6	86162	86167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168372
1553	NC_015184	GGT	2	6	86201	86206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168372
1554	NC_015184	AAT	2	6	86221	86226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168372
1555	NC_015184	CCA	2	6	86232	86237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168372
1556	NC_015184	CAG	2	6	86247	86252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168372
1557	NC_015184	TGGC	2	8	86313	86320	0 %	25 %	50 %	25 %	325168372
1558	NC_015184	CAGTTT	2	12	86531	86542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325168372
1559	NC_015184	TCC	2	6	86544	86549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168372
1560	NC_015184	ATT	2	6	86720	86725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168373
1561	NC_015184	GCG	2	6	86733	86738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168373
1562	NC_015184	TGC	2	6	86873	86878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1563	NC_015184	CGA	2	6	86930	86935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1564	NC_015184	TGC	2	6	86956	86961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1565	NC_015184	CCG	3	9	86998	87006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168373
1566	NC_015184	ACA	2	6	87112	87117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168373
1567	NC_015184	GTT	2	6	87120	87125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168373
1568	NC_015184	CGATG	2	10	87143	87152	20 %	20 %	40 %	20 %	325168373
1569	NC_015184	GGCGCA	2	12	87167	87178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325168373
1570	NC_015184	GAC	2	6	87219	87224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1571	NC_015184	GAA	2	6	87299	87304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168373
1572	NC_015184	ACT	2	6	87313	87318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168373
1573	NC_015184	AGC	2	6	87331	87336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1574	NC_015184	GGT	2	6	87348	87353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168373
1575	NC_015184	TTG	2	6	87367	87372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168373
1576	NC_015184	TGT	2	6	87386	87391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168373
1577	NC_015184	GC	3	6	87433	87438	0 %	0 %	50 %	50 %	325168373
1578	NC_015184	TGC	2	6	87445	87450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1579	NC_015184	GCC	2	6	87458	87463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168373
1580	NC_015184	TTG	2	6	87505	87510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168373
1581	NC_015184	CGC	2	6	87610	87615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168373
1582	NC_015184	GTC	2	6	87618	87623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1583	NC_015184	CAA	2	6	87653	87658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168373
1584	NC_015184	CGG	2	6	87691	87696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168373
1585	NC_015184	GCT	2	6	87740	87745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168373
1586	NC_015184	ATC	2	6	87822	87827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168373
1587	NC_015184	CCG	2	6	87847	87852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168373
1588	NC_015184	ATT	2	6	87937	87942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168373
1589	NC_015184	TGA	2	6	88091	88096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168373
1590	NC_015184	GATGCA	2	12	88390	88401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325168374
1591	NC_015184	GCC	2	6	88408	88413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168374
1592	NC_015184	CTGG	2	8	88461	88468	0 %	25 %	50 %	25 %	325168374
1593	NC_015184	TGC	2	6	88532	88537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1594	NC_015184	GGC	2	6	88636	88641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168374
1595	NC_015184	TTG	2	6	88655	88660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168374
1596	NC_015184	TGC	2	6	88673	88678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1597	NC_015184	ACG	2	6	88772	88777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1598	NC_015184	ATCT	2	8	88795	88802	25 %	50 %	0 %	25 %	325168374
1599	NC_015184	TGC	2	6	88826	88831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1600	NC_015184	TCGT	2	8	88847	88854	0 %	50 %	25 %	25 %	325168374
1601	NC_015184	TGC	2	6	88880	88885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1602	NC_015184	ATTAC	2	10	88892	88901	40 %	40 %	0 %	20 %	325168374
1603	NC_015184	GGC	2	6	88929	88934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168374
1604	NC_015184	TCT	2	6	89007	89012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168374
1605	NC_015184	CGG	2	6	89013	89018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168374
1606	NC_015184	GTG	2	6	89026	89031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168374
1607	NC_015184	TCG	2	6	89069	89074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1608	NC_015184	CTGC	2	8	89112	89119	0 %	25 %	25 %	50 %	325168374
1609	NC_015184	CTG	2	6	89152	89157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168374
1610	NC_015184	CGG	2	6	89231	89236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168375
1611	NC_015184	T	6	6	89252	89257	0 %	100 %	0 %	0 %	325168375
1612	NC_015184	GCG	2	6	89262	89267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168375
1613	NC_015184	TTGGC	2	10	89348	89357	0 %	40 %	40 %	20 %	325168375
1614	NC_015184	TGA	2	6	89392	89397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168375
1615	NC_015184	TG	3	6	89435	89440	0 %	50 %	50 %	0 %	325168375
1616	NC_015184	GGAC	2	8	89497	89504	25 %	0 %	50 %	25 %	325168375
1617	NC_015184	TCA	2	6	89509	89514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168375
1618	NC_015184	GCT	2	6	89531	89536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168375
1619	NC_015184	GCTGGC	2	12	89555	89566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325168375
1620	NC_015184	GCT	2	6	89567	89572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168375
1621	NC_015184	CAT	2	6	89600	89605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168375
1622	NC_015184	GTG	2	6	89646	89651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168375
1623	NC_015184	TAT	2	6	89702	89707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168375
1624	NC_015184	TGC	2	6	89800	89805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168375
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1868	NC_015184	CGAC	2	8	104098	104105	25 %	0 %	25 %	50 %	325168388
1869	NC_015184	CGTT	2	8	104143	104150	0 %	50 %	25 %	25 %	325168388
1870	NC_015184	TCA	2	6	104183	104188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168388
1871	NC_015184	GCA	3	9	104274	104282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168389
1872	NC_015184	ATC	2	6	104333	104338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168389
1873	NC_015184	ACAAA	2	10	104352	104361	80 %	0 %	0 %	20 %	325168389
1874	NC_015184	TC	4	8	104385	104392	0 %	50 %	0 %	50 %	325168389
1875	NC_015184	GGGC	2	8	104395	104402	0 %	0 %	75 %	25 %	325168389
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1877	NC_015184	GAC	2	6	104438	104443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168389
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1879	NC_015184	CG	3	6	104605	104610	0 %	0 %	50 %	50 %	325168389
1880	NC_015184	GGT	2	6	104647	104652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168389
1881	NC_015184	ATG	2	6	104675	104680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168389
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1884	NC_015184	CGG	2	6	105019	105024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168389
1885	NC_015184	CGGG	2	8	105116	105123	0 %	0 %	75 %	25 %	325168390
1886	NC_015184	TGA	2	6	105160	105165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168390
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1888	NC_015184	CGA	2	6	105292	105297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168390
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1895	NC_015184	GCGA	2	8	105596	105603	25 %	0 %	50 %	25 %	325168390
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1903	NC_015184	GC	3	6	106088	106093	0 %	0 %	50 %	50 %	325168391
1904	NC_015184	CGC	2	6	106096	106101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168391
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1982	NC_015184	ATCG	2	8	110595	110602	25 %	25 %	25 %	25 %	325168398
1983	NC_015184	GC	3	6	110617	110622	0 %	0 %	50 %	50 %	325168398
1984	NC_015184	GAC	2	6	110631	110636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168398
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1986	NC_015184	CAGT	2	8	110935	110942	25 %	25 %	25 %	25 %	325168399
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1990	NC_015184	GCG	2	6	111153	111158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168399
1991	NC_015184	TCA	2	6	111237	111242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168399
1992	NC_015184	ATC	2	6	111276	111281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168399
1993	NC_015184	CTT	2	6	111310	111315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168399
1994	NC_015184	TGCA	2	8	111490	111497	25 %	25 %	25 %	25 %	325168399
1995	NC_015184	GCG	2	6	111535	111540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168399
1996	NC_015184	CAG	2	6	111599	111604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168399
1997	NC_015184	TCC	2	6	111632	111637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168399
1998	NC_015184	GCG	3	9	111723	111731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168399
1999	NC_015184	CCA	2	6	111744	111749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168399
2000	NC_015184	GGC	2	6	111793	111798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168399

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